(一)學位課程審核。在研究生課程(專業課程除外)學習完成後，導師及研究生管理部門應對其課程學習情況進行全面檢查，培養方案中全部課程成績合格後才能進行開題報告。
(二)撰寫合格的文獻綜述及開題報告。在進行開題之前，研究生必須撰寫一份內容充實、思路清晰的高質量文獻綜述，並在此基礎上立題，撰寫開題報告。開題報告應包括以下內容：(1)課題研究目的，其理論與實際意義，國內外的研究動態和發展趨勢;(2)課題研究生的內容和主要研究方法、技術路線;(3)完成課題的條件;(4)研究進度、具體安排及預期結果等。研究生提交開題報告後，應交由導師認真審核，並準備好有關的參考文獻和作為開題依據的各種理論分析或預實驗實驗數據。
(三)填寫開題報告申請表。做好以上工作後，研究生應嚮導師及所在二級單位研究生主管部門提出申請，以便安排開題報告的具體時間、地點，並將審批後的申請表及開題報告(含文獻綜述)一份報送學校研究生處培養科備案，領取研究生開題報告評議表。
(四)博士研究生開題報告會應向全校公開進行，接受質疑，並由博士生導師、學位委員會成員、分委會成員及校外專家組成的開題報告3~5人考評小組對博士生的論文開題報告進行全面評議，分別對選題依據、創新性、選題難度、可行性、研究工作方案的合理性，科研工作時間安排的合理性，經費支持及研究生的口頭報告等方面進行評議及打分，加權後得分及格，方可正式開題。不符合要求者必須重新開題。若評議為科研能力差，缺乏培養前途的博士生，不能進入論文階段，改為對其進行中期篩選。碩士研究生可在二級學院內完成。
(五)開題報告評議表是研究生開題工作，及研究生學位論文選題得以確定的的重要憑證。該表應現場填寫，在給出相應評審意見後，考評專家須當場簽字，並送交研究生處學位辦備案。導師及研究生個人複印留底保存。
(六)在職人員以同等學力申請醫學科學碩士學位、臨牀醫學碩士專業學位、哲學碩士學位及臨牀醫學博士專業學位，按上述程序進行。