自從我國改革開放的完成，每一家醫院都根據我國的《醫會制度》為根據制定了相應的財務管理方面的制度，對醫院內部相關表的財務管理工作進行了一定程度的加強。詳細內容請看下文醫院會計制度的分析。
在實現對醫院內部再生產的同時對相關的衞生事業的良性發展起到了極大的促進作用。與此同時，絕大部分的醫院相關的會計工作也實現了現代化以及現代化;個別大型醫院還對總會計師責任制度進行了一定程度的踐行，使得會計工作逐漸向現代化以及規範化靠攏。但是就目前而言，我國的會計制度中還有很多的紕漏以及不足。
（一）醫院壞賬準備相關的提取並不完善
醫院的壞賬準備會隨着社會統籌病人的增多而不斷增多，即使醫院醫保制度執行得很規範，也會以“超大盤”的形式而扣減，有時扣減率高達30%。雖然醫院可以按會計制度計提壞賬準備，但計提的壞賬準備遠低於可能發生的壞賬。壞賬準備按國家統一的比例提取，且已經發生的壞賬損失須經財政部門批准後方可沖銷，致使大量呆賬、壞賬長期掛在賬上，妨礙了資金的週轉，也使醫院的流動指標、償債能力失真，影響了投資者的決策。
（二）虛假增加了固定資產的實際價值
在醫院對《醫會制度》進行執行的過程中，對於固定資產方面並不依照折舊金計算。在醫院的資產負債記錄表上，對於固定資產項目數額的記錄只是記錄為原數額，並沒有進行有效地折舊處理，使得實際資產數額與財務報表上的記錄之間存在較大的出入。