一、統一思想認識，動員部署工作
5月31日，福建省政府組織省發改委、經貿委、監察廳、司法廳、工商局、安監局、環保局、福州電監辦等8部門參加了“全國整治違法排污企業保障羣眾健康環保專項行動”電視電話會議。全省共設置84個分會場，參會人員約1650人，各市、縣（市、區）的政府領導和專項行動成員單位負責人蔘加了會議。
全國會議結束後，福建省政府緊接着召開全省電視電話會議，副省長李川在會上進行了動員部署，強調各級政府各有關部門要統一思想，充分認識環保專項行動的重要性和緊迫性，嚴格按照全國的統一部署，落實專項行動的各項工作；要求各級政府要切實擔負起打擊違法排污、保障羣眾健康的責任，加強組織領導，成立相應的機構實行統一領導，周密部署，層層落實；各部門要在政府的統一領導下，各司其職，進一步完善部門聯動工作機制，落實聯合辦案和案件移送制度，相互支持，密切配合，形成整體合力，務求環保專項行動取得實效。各設區市政府也都召開了會議，貫徹落實國家和省電視電話會議精神，動員部署本地區環保專項行動工作。
省環保局將環保專項行動列入今年的一項重點工作，有關工作早研究、早部署，全國電視電話會議前就組織人員牽頭起草了全省專項行動實施方案；會議結束後，結合會議精神，進一步修改完善實施方案，及時送相關部門會籤。各部門（委、廳、局）參加全國電視電話會議的分管領導及時將國家今年環保專項行動的要求向本單位黨組作了彙報，組織本單位相關處室負責人及有關人員傳達學習貫徹會議精神。
二、成立工作機構，加強組織領導
我省整治違法排污企業保障羣眾健康環保專項行動由省政府統一領導，各級各部門協同配合統一行動。省環保局已聯合省發改委、經貿委、監察廳、工商局、司法廳、安監局、福州電監辦等8個部門報請省政府成立福建省整治違法排污企業保障羣眾健康環保專項行動領導小組，組長擬由分管副省長蘇增添擔任，副組長擬由省監察廳廳長陳倫、省環保局局長李在明和省政府辦公廳副主任林寶金擔任，成員擬由環保局其他領導和另外7個部門的分管領導組成。領導小組下設辦公室，掛靠省環保局，由省環保局局長李在明兼任辦公室主任，辦公室成員由各委（廳、局）有關處（室）負責人組成。
為更好地履行牽頭組織協調職責，省環保局成立了由局長李在明為組長，其他局領導為副組長的省環保局專項整治行動領導小組。領導小組下設辦公室，由分管副局長陳寧兼任辦公室主任，機關職能處（室）、直屬單位負責人為成員，具體負責組織協調環保專項行動的各項工作。同時，將專項行動環保部門的各項工作進行分解細化，層層落實，明確各單位的職責和責任人。
三、制定實施方案，明確工作任務
5月23日，收到國家環保總局等7部門《關於開展整治違法排污企業保障羣眾健康環保專項行動的通知》後，省環保局領導高度重視，立即召集人員學習領會文件精神，組織部署有關工作，要求環保部門要切實履行牽頭組織的職責，抓緊起草行動實施方案。
為確保環保專項整治行動取得實效，根據我省實際情況，福建省環保局、發改委、經貿委、監察廳、工商局、司法廳、安監局、福州電監辦聯合制定了《XX年福建省整治違法排污企業保障羣眾健康環保專項行動實施方案》，目前已完成文件的會籤，正報請省政府審定後印發給各地實施。《實施方案》明確了整治的工作重點和各成員單位的職責，並提出具體工作要求和保障措施等。《實施方案》結合實際，突出重點，兼顧全面，在國家集中整治威脅飲用水源安全的污染和隱患，集中整治工業園區的環境違法問題和集中整治建設項目環境違法問題3個整治重點的基礎上，增加了集中整治危險廢物收集、貯存、運輸、處置中存在的突出問題和以往環保專項行動和環境安全大檢查掛牌督辦企業的環境問題2個工作重點。